È lo stesso problema di chi è abituato a gestire la musica per cartelle e passa a iTunes o sistemi simili basati su metadati.i file musicali sono organizzati per genere, artista, album, non per cartelle, è una scelta, se vuoi discutibile, ma non mi sembra un problema così insormontabile
Una volta messo ordine, creso sia molto più comodo questo approccio consentendo la consultazione per playlist, album, generi, ecc.